Москву благодаря системе каналов называют портом пяти морей. Однако водный транспорт в городе выполняет скорее экскурсионно-рекреационные функции, нежели чем функции пассажирского транспорта. От Северного и Южного речных вокзалов ходят круизные теплоходы дальних линий. В центре Москвы и в некоторых районах города курсируют прогулочные теплоходы. Общее количество причалов в городе, на которых останавливаются прогулочные теплоходы - около 20. Речная пассажирская навигация в городе длится с начала апреля по середину октября, а грузовая – немного дольше.

Скоростной транспорт Москвы представлен одной из крупнейшей в мире системой метрополитена, линией монорельсовой дороги, а также железнодорожным транспортом. Основным внеуличным видом городского транспорта в Москве является Московский метрополитен, ежедневно перевозящий в среднем 7,1 млн пассажиров. По пассажиропотоку московское метро уступает в мире только токийскому. Московский метрополитен состоит из 12 линий общей длиной 298,8 км в двухпутном исчислении, 180 станций. Количество вагонов составляет 4510, обслуживанием которых занимаются 15 депо.

Наземный общественный транспорт Москвы представлен автобусом, троллейбусом, трамваем и маршрутным такси. Основным оператором городского наземного пассажирского транспорта, объединяющим автобус, троллейбус и трамвай, является ГУП "Мосгортранс". "Мосгортранс" обеспечивает выполнение 37,5% от общего объема осуществляемых в городе пассажироперевозок общественным транспортом, перевозит около 1,85 млрд пассажиров в год, и является одной из крупнейших в мире транспортной компанией.

В Москве имеется развитая транспортная инфраструктура – три транспортных кольца: Садовое, Третье транспортное и Московская кольцевая автомобильная дорога (МКАД). В настоящий момент ведется строительство Четвертого транспортного кольца, а также в Подмосковье планируется строительство Центральной кольцевой автомобильной дороги (ЦКАД), которая поможет разгрузить МКАД от транзитного транспортного потока. В городе зарегистрировано более 3 млн личного автотранспорта, а уровень автомобилизации превысил показатель 339 автомобилей на 1000 жителей, что приводит с учетом транспорта других регионов, к большим затруднениям движения транспорта в городе.

Москву обслуживают три международных аэропорта: "Домодедово", "Шереметьево" и "Внуково". Их доля в общем объеме перевозок пассажиров в России составляет более 55%. Всего в 2008 году три аэропорта столицы обслужили более 43,5 млн пассажиров. Ближайшим к центру Москвы и единственным действующим аэропортом, расположенным в черте города, является "Внуково". Из этого аэропорта осуществляются преимущественно внутрироссийские и чартерные рейсы. В аэропорту "Шереметьево" базируется крупнейший перевозчик России – "Аэрофлот". Между тем, аэропорт "Домодедово" является лидером московского авиаузла по пассажиропотоку и по мнению многих опросов, одним из лучших аэропортов Восточной Европы.